اهم مأموریت های این معاونت عبارتند از:
- توسعه زیست بوم نوآوری و فناوری
- پیشبرد اهداف کلان سازمان در راستای کارآفرینی فناورانه و اقتصاد دانش بنیان
- تأسیس پردیس های مشترک علم و فناوری با دانشگاه ها و مؤسسات پژوهشی
- توسعه تعاملات بین المللی پارک و شرکت های فناور مستقر
- گسترش همکاری های پژوهشی و فناوری میان شرکت های مستقر در پارک با پژوهشگاه فناوری های نوین
- مدیریت و راهبری سامانه (پلتفرم) پارک