مرکز کلکسیون میکروارگانیسم های صنعتی

ارائه DNA ژنومی باکتری‌ها

مرکز کلکسیون میکروارگانیسم‌های صنعتی، در راستای حمایت از فعالیت‌های پژوهشی، آموزشی و صنعتی، امکان تأمین و ارائه DNA ژنومی استخراج‌شده از سویه‌های باکتریایی موجود در کلکسیون را برای پژوهشگران، دانشگاه‌ها، مراکز تحقیقاتی، شرکت‌های دانش‌بنیان و صنایع زیست‌فناوری فراهم کرده است.

DNA ژنومی از سویه‌های باکتریایی نگهداری‌شده در کلکسیون، با استفاده از روش‌های استاندارد استخراج و خالص‌سازی تهیه شده و پیش از تحویل، از نظر کیفیت و قابلیت استفاده در آزمایش‌های مولکولی مورد ارزیابی قرار می‌گیرد. به منظور اطمینان از کیفیت DNA استخراج‌شده، صحت و قابلیت تکثیر آن از طریق واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) با استفاده از ژن 16S rRNA کنترل و تأیید می‌شود.

DNA ارائه‌شده برای طیف گسترده‌ای از مطالعات مولکولی مناسب است، از جمله:

• انجام انواع واکنش‌های PCR و Multiplex PCR

• تعیین توالی قطعات ژنی (Sanger Sequencing)

• شناسایی مولکولی باکتری‌ها

• مطالعات فیلوژنتیکی و تاکسونومی

• طراحی و ارزیابی آغازگرهای اختصاصی (Primer)

• پروژه‌های تحقیقاتی، پایان‌نامه‌ها و مقالات علمی

• کنترل‌های مثبت در آزمون‌های مولکولی و توسعه کیت‌های تشخیصی

DNAهای ارائه‌شده برای کاربردهای مبتنی بر PCR و توالی‌یابی قطعات ژنومی کوتاه مناسب هستند. در صورتی که متقاضی به DNA با وزن مولکولی بسیار بالا و کیفیت ویژه برای کاربردهایی مانند توالی‌یابی کل ژنوم (Whole Genome Sequencing)، Long-read Sequencing یا سایر فناوری‌های پیشرفته نیاز داشته باشد، لازم است این موضوع هنگام ثبت درخواست اعلام شود تا امکان‌سنجی و آماده‌سازی نمونه مطابق نیاز پروژه انجام گیرد.

گزارش ارائه‌شده همراه نمونه شامل مشخصات سویه، روش کنترل کیفیت و تأیید قابلیت استفاده DNA در آزمون‌های مولکولی خواهد بود.

ارائه DNA ژنومی قارچ‌ها

مرکز کلکسیون میکروارگانیسم‌های صنعتی خدمات استخراج و ارائه DNA ژنومی قارچ‌های رشته‌ای موجود در کلکسیون را برای استفاده در مطالعات مولکولی، پژوهش‌های تاکسونومی، زیست‌فناوری و تشخیص مولکولی ارائه می‌دهد.

DNA ژنومی قارچ‌ها با استفاده از روش‌های استاندارد استخراج و خالص‌سازی تهیه شده و پس از کنترل کیفیت، در اختیار متقاضی قرار می‌گیرد. این DNA از خلوص و کیفیت مناسب برای انجام انواع واکنش‌های PCR و تکثیر نواحی ژنی متداول در شناسایی قارچ‌ها (مانند ITS، LSU، SSU، β-tubulin، TEF1-α و سایر نشانگرهای مولکولی) برخوردار است.

از DNA ژنومی قارچ‌های ارائه‌شده می‌توان در کاربردهای مختلفی استفاده کرد، از جمله:

• شناسایی مولکولی قارچ‌ها

• تعیین توالی نواحی ژنی

• مطالعات فیلوژنتیکی و تاکسونومی

• طراحی و ارزیابی آغازگرهای اختصاصی

• مطالعات تنوع ژنتیکی

• پروژه‌های تحقیقاتی و پایان‌نامه‌های دانشگاهی

• کنترل‌های مثبت در آزمون‌های مولکولی

با توجه به اینکه برخی از قارچ‌های رشته‌ای رشد آهسته‌ای دارند، آماده‌سازی زیست‌توده کافی برای استخراج DNA ممکن است به زمان بیشتری نیاز داشته باشد. در این موارد، فرآیند آماده‌سازی و کنترل کیفیت نمونه معمولاً ۴ تا ۶ هفته به طول خواهد انجامید.

گزارش نهایی شامل مشخصات سویه، وضعیت کنترل کیفیت و تأیید قابلیت استفاده DNA در واکنش‌های PCR خواهد بود. در صورت نیاز، امکان هماهنگی برای استخراج DNA از سویه‌های خاص و ارائه خدمات متناسب با نیازهای پژوهشی و صنعتی متقاضی نیز وجود دارد.